Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FOXD4Q12950 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4Q12950 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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