Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2AQ12879 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
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