Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB40BQ12829 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms