Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFEMP1Q12805 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms