Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3C1Q12789 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms