Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXO1Q12778 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXO1Q12778 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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