Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RBBP4Q09028 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms