Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms