Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TGM3Q08188 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms