Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLEQ07864 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms