Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms