Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPB1Q06547 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GABPB1Q06547 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms