Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NOTCH2Q04721 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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