Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms