Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms