Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC1Q01954 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms