Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FANCCQ00597 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms