Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IRX1P78414 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRX1P78414 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRX1P78414 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRX1P78414 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRX1P78414 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms