Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCALDP61601 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCALDP61601 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCALDP61601 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCALDP61601 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCALDP61601 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCALDP61601 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCALDP61601 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCALDP61601 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCALDP61601 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCALDP61601 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCALDP61601 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCALDP61601 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCALDP61601 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCALDP61601 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCALDP61601 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCALDP61601 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCALDP61601 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms