Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAP25P60880 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAP25P60880 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms