Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms