Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLDN8P56748 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms