Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP6P55212 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP6P55212 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms