Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP9P55211 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP9P55211 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP9P55211 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP9P55211 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP9P55211 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP9P55211 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CASP9P55211 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CASP9P55211 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms