Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP153P49790 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP153P49790 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP153P49790 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP153P49790 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP153P49790 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP153P49790 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms