Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRPC1P48995 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms