Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRATP43155 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRATP43155 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRATP43155 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRATP43155 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms