Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMPOP42166 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMPOP42166 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms