Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDH1P40925 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDH1P40925 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDH1P40925 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDH1P40925 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms