Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms