Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LTBRP36941 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBRP36941 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBRP36941 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBRP36941 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBRP36941 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LTBRP36941 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LTBRP36941 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LTBRP36941 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms