Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNB1P35222 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms