Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALDH4A1P30038 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALDH4A1P30038 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms