Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms