Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJB2P29033 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB2P29033 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms