Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLD1P28340 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLD1P28340 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLD1P28340 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms