Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms