Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMA3P25788 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms