Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms