Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CALB2P22676 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms