Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USF1P22415 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USF1P22415 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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