Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms