Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB1P20618 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB1P20618 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms