Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms