Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTLA4P16410 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms