Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNNT1P13805 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms