Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRG2P13727 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms