Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms