Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
IFITM1P13164 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IFITM1P13164 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms