Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A1P11836 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms